В 2017 году Орган по сертификации ФГБУ «ВГНКИ» был успешно аккредитован в национальной системе аккредитации. В соответствии с требованиями п. 1 ч. 1 ст. 24 Федерального закона от 28.12.2013 № 412-ФЗ «Об аккредитации в национальной системе аккредитации» аккредитованное лицо обязано проходить процедуру подтверждения компетентности в течение первого года со дня аккредитации.
С 22.03.2018 по 26.03.2018 экспертной группой, назначенной приказом Федеральной службы по аккредитации, в составе трех человек была проведена выездная оценка для проверки деятельности Органа по сертификации ФГБУ «ВГНКИ».
По результатам прохождения процедуры подтверждения компетентности приказом Федеральной службы по аккредитации от 08.05.2018 № ПК1-883 было признано соответствие Органа по сертификации ФГБУ «ВГНКИ» требованиям действующего законодательства в области оценки соответствия ветеринарных препаратов, кормов для животных и зерна.